Fatih Eğitim Fakültesinin çekirdeğini 1963-1964 eğitim-öğretim yılında açılan iki yıllık Fatih Eğitim Enstitüsü oluşturur. 1963-1964 eğitim-öğretim yılında iki yıllık Fatih Eğitim Enstitüsü adıyla açılmıştır. 1968 yılında öğretim süresi üç yıla çıkarılmıştır. 1978 yılında eğitim süresi dört yıla çıkarılarak Fatih Yüksek Öğretmen Okulu adını almıştır.

Türkiye'de yükseköğretim, 1981’de çıkarılan 2547 sayılı Yükseköğretim Kanunu ile akademik, kurumsal ve idari yönden yeniden yapılanma sürecine girmiştir. Bu kanunla ülkemizdeki tüm yükseköğretim kurumları Yükseköğretim Kurulu (YÖK) çatısı altında toplanmış, akademiler üniversitelere, eğitim enstitüleri eğitim fakültelerine dönüştürülmüş ve konservatuvarlar ile meslek yüksekokulları üniversitelere bağlanmıştır. Bu bağlamda 1982 yılında Fatih Yüksek Öğretmen Okulu, Fakülte’ ye dönüştürülerek, Karadeniz Teknik Üniversitesi'ne bağlanmıştır. Daha sonra 18.05.2018 tarihli ve 30425 sayılı Resmî Gazetede yayımlanan 7141 sayılı kanun ile kurulan Trabzon Üniversitesi'ne bağlanmıştır. Bu tarihten itibaren Sınıf Eğitimi Anabilim Dalı Trabzon Üniversitesi bünyesinde eğitim-öğretime devam etmektedir.

Sınıf Öğretmenliği Programı 1988 yılında kurulmuş olup 1998 yılından bu yana İlköğretim Bölümü bünyesinde lisans düzeyinde eğitim-öğretim faaliyetlerini yürütmektedir. Ayrıca 2010 yılından itibaren yüksek lisans ve 2015 yılından itibaren de doktora programı ile lisansüstü düzeyde öğrenci yetiştirmektedir. Sınıf Öğretmenliği programını başarı ile tamamlayan öğrencilerin almış oldukları diploma Avrupa Birliği ülkelerinde geçerlidir.